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思腾合力 HPC 高性能计算解决方案,帮助用户更快更深入地解决棘手难题

来源:恒创科技 编辑:恒创科技编辑部
2022-08-18 14:38:05

HPC 本质上是一个多元化的市场,应用程序跨越多个领域,大多数领域中都存在 GPU 加速应用程序,包括化学研究、流体力学分析、结构分析、环境建模、地球物理学、可视化/图像处理和物理等,这些应用涉及大量的计算力以及计算精度需求。



|解决方案


NVIDIA 构建的软件生态系统以支持在硬件方面的投入,通过开发了一套并行编程 API、库和相关的软件开发工具 CUDA(Compute Unified Device Architecture) 支持 GPU 平台的应用程序开发,包括 OpenCL 开放的标准框架、各种处理器架构加速和 OpenACC (高级语言的标准编译器指令),可采用搭载 NVIDIA Tesla 计算卡的 GPU 服务器+HPC 基础软件环境+集群管理软件的整体解决方案。


思腾合力 HPC 高性能计算解决方案,帮助用户更快更深入地解决棘手难题_高性能计算



|方案价值


因为目前大部分的 HPC 软件已支持 NVIDIA 的 GPU 计算卡,本方案通过 GPU 算力加速 HPC 应用,效率相比于传统的 CPU 服务器有跨越式的提升。


案例:中国科学院工程热物理研究所HPC集群建设



VASP(Vienna Ab Initio Simulation Program)是一款原子分子模拟应用,可对原子分子的行为进行电子级建模。软件进行分子动力学模拟,需要高性能计算服务器进行VASP加速。


思腾合力 HPC 高性能计算解决方案,帮助用户更快更深入地解决棘手难题_解决方案_02



|解决方案


12 节点思腾合力 IW4213-4G

13 节点思腾合力 IW4210-8G

PBS 作业调度软件

HPC 基础软件环境


|客户收益


现代高性能计算数据中心是解决世界上一些最重要的科学和工程挑战的关键。NVIDIA Tesla 加速计算平台为这些现代数据中心提供了业界领先的应用程序,以加速高性能计算和人工智能工作负载。在 NVIDIA Tesla 加速计算平台的加持下,VASP 模拟计算的性能相比 CPU 可加快 2.5 倍到 4 倍,帮助用户更快更深入地解决最棘手难题。


案例:中科院遗传与发育生物研究所冷冻电镜计算平台建设



冷冻电镜三维重构技术是解析大分子晶体结构、研究生命本质的有力手段,为达到原子级别的分辨率,往往需要处理数十万张图片,因此需要有高性能的处理能力。


思腾合力 HPC 高性能计算解决方案,帮助用户更快更深入地解决棘手难题_高性能计算_03



|解决方案


3 节点思腾合力 IW4213-4G

1 节点 24 盘位高性能存储服务器

10G SFP+光纤以太组网


|客户收益


通过 GPU 来加速图形处理、进而重建高分子结构,通过 GPU 并行加速,实现蛋白颗粒的分组,结构重构以及结果优化。GPU 加速运算指以图形处理单元(GPU搭配 CPU,藉以加速科学、工程和企业应用。GPU 加速运算提供前所未见的应用效能,能将应用程式中运算密集的工作负载转移到 GPU,并由 CPU 执行其他程式码,从而加快应用程式的执行速度。

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